等的保护费。每年仅此一项，郑芝龙收就近千万两。

郑芝龙为了和倭人贸易，也不愿长期树敌，因此在一位住在兰遮城的同安商人林亨万居间协调下，双方同意行贸易往来。于是福建商船开始驶抵台湾。东印度公司史料說：如果公司想存在下去，必须把一官这一刺从公司脚下除。

经此一役，郑芝龙声势大振，普特曼斯只好放弃与刘香勾结，改与郑芝龙修好，转而表达今后想在台湾、而不是势前往福建寻求对华贸易的意愿，由郑芝龙派船到台湾行贸易。

九死一生的刘香不满荷兰人又与郑芝龙修好，在崇祯七年四月九日清晨天亮前，利用月亮被遮住，以众六百多人袭击大员（今台南安平）的荷兰人城堡兰遮城，并且已经用云梯爬上了城墙。被荷兰哨兵发觉，经开枪和炮轰后，刘香率众逃散而去。数天后，这支海盗从雄离开台湾，李旦之李国助倒戈投降明军。

厦门的官员在驻军遭到荷兰人痛击后，采取下宁人态度，找人与荷兰人疏通，表示愿意通知厦门、金门、烈屿、鼓狼屿及附近各岛的百姓送上二十五、二十五只猪和一百只，希望荷兰人不要再伤害百姓，使他们可以继续安心耕。

崇祯八年三月二十日，郑芝龙在广东田尾洋击溃刘香海上武装集团，刘香引火自尽；但在此役，郑芝龙的胞弟郑芝虎战死。

接到福建巡抚表奏朝廷：“芝龙果建奇功，俘其丑类，为海上十数年所未有。”崇祯龙颜大悦，加封郑芝龙

崇祯六年七月，新任荷兰台湾长官普特曼斯为迫使明朝开放贸易，企图用武力占大陆沿海，在刘香的帮助下，不宣而战，派八艘战舰，对刚刚追剿刘香回到厦门洝庇薪浔傅闹Ｖチ和明朝官兵发动突袭。击沉、烧毁和沉港內郑芝龙和明朝官兵的二十几艘战船。这些船只是郑芝龙的锐队，也是当时中国最先的海上武裝船队，船上备完善，架有十六、二十到三十六门大炮。

埃建巡抚邹维琏檄调诸将，大集舟师，准备痛击荷兰侵略者，任“五虎游击将军”的郑芝龙担任战斗前锋，实际负责运筹指挥这场战斗。郑芝龙舟渡漳州海澄，誓师发。不久在澎湖的遭遇战中，焚毁荷船一艘，生擒荷将一名，溺死荷兵数百。

十月二十二日，由郑芝龙带领，明军一百五艘左右的帆船（其中五十艘为特大战船）在金门料罗湾追上荷兰大船九艘、刘香船五十多艘。郑芝龙报仇心切，奋勇当先，使用铁钩钩住敌船纵火焚烧战术，共焚毁荷兰快艇一艘，并捕获另一艘快艇。刘香临阵败逃，普特曼斯狼狈退回台湾。

同年九月，普特曼斯与刘香在台湾的大员汇合，准备再度攻郑芝龙。

崇祯五年十二月四日，郑芝龙与刘香的船队在福州附近遭遇，发生血战，从早上打到傍晚，双方各死伤八百到一千人。郑芝龙弟弟郑芝虎在上两负伤的情況下，冲敌阵，被刘香的人用四爪锚和铁链缠住，几乎不能脫，后来是下拼死救。刘香本人则向南逃逸而去。

刘香势力在广东崛起后，台湾海峽又转向不平靜。郑芝龙的船队刘香虽然较少打劫，但他每月从各个船队上的成却损失大，熊文灿调走后，新上任的福建巡抚邹维琏宣布恢复海禁，并力阻郑芝龙与在台湾的荷兰人私下通商。郑芝龙扫除刘香，而在此之前，原为郑芝龙旧的李魁启和钟斌也先后叛离，但都遭到郑芝龙扫除，刘香成了他原先一起结伙的海寇中最后的对，也是最难应付的一势力。

可是郑芝龙受明朝招抚后，原先与他一起生死的刘香一势力心有不甘，拉到广东，继续其海上劫掠营生。刘香势力与荷兰人勾結，在一段时间內不但频频劫掠福建，广东沿海一带，对郑芝龙的般队也造成很大威胁